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Model simplification of signal transduction pathway networks via a hybrid inference strategy

机译:通过混合推理策略简化信号转导通路网络的模型

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摘要

A full-scale mathematical model of cellular networks normally involves a large number of variables and parameters. How to effectively develop manageable and reliable models is crucial for effective computation, analysis and design of such systems. The aim of model simplification is to eliminate parts of a model that are unimportant for the properties of interest. In this work, a model reduction strategy via hybrid inference is proposed for signal pathway networks. It integrates multiple techniques including conservation analysis, local sensitivity analysis, principal component analysis and flux analysis to identify the reactions and variables that can be considered to be eliminated from the full-scale model. Using an I·B-NF-·B signalling pathway model as an example, simulation analysis demonstrates that the simplified model quantitatively predicts the dynamic behaviours of the network.
机译:蜂窝网络的全面数学模型通常包含大量变量和参数。如何有效开发可管理和可靠的模型对于此类系统的有效计算,分析和设计至关重要。简化模型的目的是消除模型中对目标属性不重要的部分。在这项工作中,提出了一种通过混合推理的模型简化策略,用于信号通路网络。它集成了多种技术,包括保守性分析,局部敏感性分析,主成分分析和通量分析,以识别可认为已从全面模型中消除的反应和变量。仿真分析以I·B-NF-·B信号通路模型为例,表明简化模型定量预测了网络的动态行为。

著录项

  • 作者

    Jia, Jianfang; Yue, Hong;

  • 作者单位
  • 年度 2008
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 {"code":"en","name":"English","id":9}
  • 中图分类

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